MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c plasmid pXF1.3

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002489	C	6	6	5	10	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_002489	C	6	6	14	19	0 %	0 %	0 %	100 %	10956709
3	NC_002489	CTCG	2	8	22	29	0 %	25 %	25 %	50 %	10956709
4	NC_002489	C	6	6	235	240	0 %	0 %	0 %	100 %	10956709
5	NC_002489	CAC	2	6	243	248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956709
6	NC_002489	GAT	2	6	255	260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956709
7	NC_002489	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956709
8	NC_002489	GCG	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956709
9	NC_002489	TGCT	2	8	395	402	0 %	50 %	25 %	25 %	10956709
10	NC_002489	AAT	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10956709
11	NC_002489	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956709
12	NC_002489	CAC	2	6	465	470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956709
13	NC_002489	AGG	2	6	471	476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10956709
14	NC_002489	CACG	2	8	629	636	25 %	0 %	25 %	50 %	10956709
15	NC_002489	AGG	2	6	664	669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10956709
16	NC_002489	ACC	2	6	771	776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956709
17	NC_002489	CCTCG	2	10	783	792	0 %	20 %	20 %	60 %	10956709
18	NC_002489	TGA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956709
19	NC_002489	ACC	2	6	829	834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956709
20	NC_002489	T	7	7	925	931	0 %	100 %	0 %	0 %	10956710
21	NC_002489	AGGA	2	8	941	948	50 %	0 %	50 %	0 %	10956710
22	NC_002489	GGA	2	6	1001	1006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10956710
23	NC_002489	C	7	7	1014	1020	0 %	0 %	0 %	100 %	10956710
24	NC_002489	TCGCT	2	10	1030	1039	0 %	40 %	20 %	40 %	10956710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.